Research ArticleArticles
Catabolic rates, population sizes and doubling/replacement times of microorganisms in natural settings
Douglas E. LaRowe and Jan P. Amend
American Journal of Science March 2015, 315 (3) 167-203; DOI: https://doi.org/10.2475/03.2015.01
Douglas E. LaRowe
* Department of Earth Sciences, University of Southern California, Los Angeles, California 90089-0740, USA
Jan P. Amend
* Department of Earth Sciences, University of Southern California, Los Angeles, California 90089-0740, USA
** Department of Biological Sciences, University of Southern California, Los Angeles, California 90089-0371, USA

REFERENCES
- ↵
- Amend J. P.,
- Shock E. L.
- ↵
- Amend J. P.,
- McCollom T. M.,
- Hentscher M.,
- Bach W.
- ↵
- ↵
- Amy P. S.,
- Haldeman D. L.
-
- Arndt S.,
- Brumsack H.-J.,
- Wirtz K. W.
- ↵
- Bach W.,
- Edwards K. J.
- ↵
- Battley E. H.
- ↵
- Beyeler W.,
- Rogers P. L.,
- Fiechter A.
- ↵
- Biddle J. F.,
- Lipp J. S.,
- Lever M. A.,
- Lloyd K. G.,
- Sørensen K. B.,
- Anderson R.,
- Fredricks H. F.,
- Elvert M.,
- Kelly T. J.,
- Schrag D. P.,
- Sogin M. L.,
- Brenchley J. E.,
- Teske A.,
- House C. H.,
- Hinrichs K.-U.
- ↵
- ↵
- Chapelle F. H.,
- Lovley D. R.
- ↵
- Chesbro W.,
- Evans T.,
- Eifert R.
- ↵
- Colwell F. S.,
- D'Hondt S.
- ↵
- Cowen J. P.
-
- Dale A. W.,
- Sommer S.,
- Haeckel M.,
- Wallmann K.,
- Linke P.,
- Wegener G.,
- Pfannkuche O.
-
- Daniels L.,
- Sparling R.,
- Sprott G. D.
- ↵
- de Angelis M. A.,
- Lilley M. D.,
- Olson E. J.,
- Baross J. A.
-
- de Poorter L. M. I.,
- Geerts W. J.,
- Keltjens J. T.
- ↵
- D'Hondt S.,
- Rutherford S.,
- Spivack A. J.
- ↵
- ↵
- D'Hondt S.,
- Jørgensen B. B.,
- Miller D. J.,
- Batzke A.,
- Blake R.,
- Cragg B. A.,
- Cypionka H.,
- Dickens G. R.,
- Ferdelman T.,
- Hinrichs K. U.,
- Holm N. G.,
- Mitterer R.,
- Spivack A.,
- Wang G. Z.,
- Bekins B.,
- Engelen B.,
- Ford K.,
- Gettemy G.,
- Rutherford S. D.,
- Sass H.,
- Skilbeck C. G.,
- Aiello I. W.,
- Guerin G.,
- House C. H.,
- Inagaki F.,
- Meister P.,
- Naehr T.,
- Niitsuma S.,
- Parkes R. J.,
- Schippers A.,
- Smith D. C.,
- Teske A.,
- Wiegel J.,
- Padilla C. N.,
- Acosta J. L. S.
- ↵
- D'Hondt S.,
- Spivack A. J.,
- Pockalny R.,
- Ferdelman T. G.,
- Fischer J. P.,
- Kallmeyer J.,
- Abrams L. J.,
- Smith D. C.,
- Graham D.,
- Hasiuk F.,
- Schrum H.,
- Stancin A. M.
- ↵
- D'Hondt S.,
- Inagaki F.,
- Alvarez Zarikian C. A.
- ↵
- Dick J. M.,
- LaRowe D. E.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- ↵
- Edwards K. J.,
- Becker K.,
- Colwell F.
- ↵
- Fredickson J. K.,
- Fletcher M.
- ↵
- Fredickson J. K.,
- Fletcher M.
- Fredickson J. K.,
- Onstott T. C.
- ↵
- Fredickson J. K.,
- Garland T. R.,
- Hicks R. J.,
- Thomas J. M.,
- Li S. W.,
- McFadden K. M.
-
- Galchenkov V. F.,
- Ivanov M. V.,
- Lein A. Y.
- ↵
- ↵
- ↵
- Heijnen J. J.,
- van Dijken J. P.
- ↵
- ↵
- Helgeson H. C.,
- Kirkham D. H.,
- Flowers G. C.
-
- Helgeson H. C.,
- Richard L.,
- McKenzie W. F.,
- Norton D. L.,
- Schmitt A.
- ↵
-
- Holmkvist L.,
- Ferdelman T. G.,
- Jørgensen B. B.
-
- Jetten M. S. M.,
- Stams A. J. M.,
- Zehnder A. J. B.
- ↵
- Johnson J. W.,
- Oelkers E. H.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Johnston C. G.,
- Vestal J. R.
- ↵
- Jørgensen B. B.
- ↵
- Jørgensen B. B.
- ↵
- Jørgensen B. B.,
- Boetius A.
- ↵
- Jørgensen B. B.,
- D'Hondt S.
- ↵
-
- Joye S. B.,
- Boetius A.,
- Orcutt B. N.,
- Montoya J. P.,
- Schulz H. N.,
- Erickson M. J.,
- Lugo S. K.
- ↵
- Joye S. B.,
- Samarkin V. A.,
- Orcutt B. N.,
- MacDonald I. R.,
- Hinrichs K.-U.,
- Elvert M.,
- Teske A. P.,
- Lloyd K. G.,
- Lever M. A.,
- Montoya J. P.,
- Meile C. D.
-
- Kallmeyer J.,
- Boetius A.
- ↵
- Kallmeyer J.,
- Pockalny R.,
- Adhikari R. R.,
- Smith D. C.,
- D'Hondt S.
- ↵
- Amy P. S.,
- Haldeman D. L.
- Kieft T. L.,
- Phelps T. J.
-
- Kirchman D. L.,
- Hanson T. E.
- ↵
- ↵
- Kallmeyer J.,
- Wagner K.
- LaRowe D. E.,
- Amend J. P.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Dick J. M.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Regnier P.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Dale A. W.,
- Regnier P.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Dale A. W.,
- Amend J. P.,
- Van Cappellen P.
- ↵
- LaRowe D. E.,
- Dale A. W.,
- Aguilera D. R.,
- L'Heureux I.,
- Amend J. P.,
- Regnier P.
-
- Lein A. Y.,
- Pimenov N. V.,
- Ivanov M. V.
- ↵
- ↵
- Liu J.-S.,
- Vojinović V.,
- Patiño R.,
- Maskow T.,
- von Stockar U.
- ↵
- Lomstein B. A.,
- Langerhuus A. T.,
- D'Hondt S.,
- Jørgensen B. B.,
- Spivack A. J.
- ↵
- Lovley D. R.,
- Chapelle F. H.
-
- Maignien L.,
- Parkes R. J.,
- Cragg B.,
- Niemann H.,
- Knittel K.,
- Coulon S.,
- Akhmetzhanov A.,
- Boon N.
-
- Marschall E.,
- Jogler M.,
- Henssge U.,
- Overmann J.
- ↵
- McCollom T. M.
- ↵
- McCollom T. M.
- ↵
- McCollom T. M.,
- Amend J. P.
- ↵
- McCollom T. M.,
- Shock E. L.
- ↵
- McMahon S.,
- Parnell J.
- ↵
- Morono Y.,
- Terada T.,
- Nishizawa M.,
- Ito M.,
- Hillion F.,
- Takahata N.,
- Sano Y.,
- Inagaki F.
-
- Nauhaus K.,
- Albrecht M.,
- Elvert M.,
- Boetius A.,
- Widdel F.
- ↵
- Neijssel O. M.,
- Tempest D. W.
-
- Niemann H.,
- Duarte J.,
- Hensen C.,
- Omoregie E.,
- Magalhães V. H.,
- Elvert M.,
- Pinheiro L. M.,
- Kopf A.,
- Boetius A.
-
- Okabe S.,
- Nielsen P. H.,
- Characklis W. G.
- ↵
- Omoregie E. O.,
- Niemann H.,
- Mastalerz V.,
- de Lange G. J.,
- Stadnitskaia A.,
- Mascle J.,
- Foucher J.-P.,
- Boetius A.
- ↵
- Orcutt B.,
- Boetius A.,
- Elvert M.,
- Samarkin V.,
- Joye S. B.
- ↵
- Orcutt B. N.,
- Sylvan J. B.,
- Knab N. J.,
- Edwards K. J.
- ↵
- Orcutt B. N.,
- LaRowe D. E.,
- Biddle J. F.,
- Cowell F. S.,
- Glazer B. T.,
- Reese B. K.,
- Kirkpatrick J. B.,
- Lapham L.,
- Mills H. J.,
- Sylvan J. B.,
- Wankel S. D.,
- Wheat C. G.
- ↵
- Orcutt B. N.,
- LaRowe D. E.,
- Lloyd K. G.,
- Mills H.,
- Orsi W.,
- Reese B. K.,
- Sauvage J.,
- Huber J. A.,
- Amend J. P.
- ↵
- Parkes R. J.,
- Cragg B. A.,
- Fry J. C.,
- Herbert R. A.,
- Wimpenny J. W. T.,
- Allen J. A.,
- Whitfield M.
- ↵
- Parkes R. J.,
- Cragg B. A.,
- Bale S. J.,
- Getliff J. M.,
- Goodman K.,
- Rochelle P. A.,
- Fry J. C.,
- Weightman A. J.,
- Harvey S. M.
- ↵
- Parkes R. J.,
- Cragg B. A.,
- Wellsbury P.
-
- Parkes R. J.,
- Webster G.,
- Cragg B. A.,
- Weightman A. J.,
- Newberry C. J.,
- Ferdelman T. G.,
- Kallmeyer J.,
- Jørgensen B. B.,
- Aiello I. W.,
- Fry J. C.
- ↵
- Phelps T. J.,
- Murphy E. M.,
- Pfiffner S. M.,
- White D. C.
- ↵
- Pirt S. J.
- ↵
- Pirt S. J.
- ↵
- Price P. B.,
- Sowers T.
-
- Rinker K. D.,
- Kelly R. M.
- ↵
- Rittman B. E.,
- McCarty P. L.
-
- Robinson J. A.,
- Tiedje J. M.
- ↵
- Roszak D. B.,
- Colwell R. R.
- ↵
- Røy H.,
- Kallmeyer J.,
- Adhikari R. R.,
- Pockalny R.,
- Jørgensen B. B.,
- D'Hondt S.
- ↵
- Russell J. B.,
- Cook G. M.
- ↵
- Schippers A.,
- Neretin L. N.,
- Kallmeyer J.,
- Ferdelman T. G.,
- Cragg B. A.,
- Parkes R. J.,
- Jørgensen B. B.
-
- Scholten J. C. M.,
- Conrad R.
- ↵
- Schrum H. N.,
- Spivack A. J.,
- Kastner M.,
- D'Hondt S.
- ↵
- Schulte M. D.,
- Shock E. L.,
- Wood R. H.
- ↵
- ↵
- ↵
- Shock E. L.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Shock E. L.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Wilcock W. S. D.,
- DeLong E. F.,
- Kelley D. S.,
- Baross J. A.,
- Cary S. C.
- Shock E. L.,
- Holland M. E.
- ↵
- Shock E. L.,
- Holland M. E.
- ↵
- Shock E. L.,
- Helgeson H. C.,
- Sverjensky D. A.
- ↵
- Shock E. L.,
- Oelkers E. H.,
- Johnson J. W.,
- Sverjensky D. A.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Shock E. L.,
- McCollom T. M.,
- Schulte M. D.
-
- Snow C. L.,
- Lilova K. I.,
- Radha A. V.,
- Shi Q.,
- Smith S.,
- Navrotsky A.,
- Boerio-Goates J.,
- Woodfield B. F.
- ↵
- ↵
- Stevens T.
- ↵
- Strapoć D.,
- Mastalerz M.,
- Dawson K.,
- Macalady J.,
- Callaghan A. V.,
- Wawrik B.,
- Turich C.,
- Ashby M.
-
- Strous M.,
- Kuenen J. G.,
- Jetten M. S. M.
- ↵
- Sverjensky D. A.,
- Shock E. L.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Tanger J. C. IV.,
- Helgeson H. C.
- ↵
- Teske A. P.
- ↵
- ↵
- Thorn P. M.,
- Ventullo R. M.
- ↵
-
- Tijhuis L.,
- van Loosdrechy M. C. M.,
- Heijnen J. J.
- ↵
- ↵
- Wang G.,
- Spivack A. J.,
- Rutherford S.,
- Manor U.,
- D'Hondt S.
- ↵
- Wang G.,
- Spivack A. J.,
- D'Hondt S.
-
- Wankel S. D.,
- Joye S. B.,
- Samarkin V. A.,
- Shah S. R.,
- Friederich G.,
- Melas-Kyriazi J.,
- Girguis P. R.
-
- Wankel S. D.,
- Germanovich L. N.,
- Lilley M. D.,
- Genc G.,
- DiPerna C. J.,
- Bradley A. S.,
- Olson E. J.,
- Girguis P. R.
- ↵
- Whitman W. B.,
- Coleman D. C.,
- Wiebe W. J.
In this issue
American Journal of Science
Vol. 315, Issue 3
1 Mar 2015
Catabolic rates, population sizes and doubling/replacement times of microorganisms in natural settings
Douglas E. LaRowe, Jan P. Amend
American Journal of Science Mar 2015, 315 (3) 167-203; DOI: 10.2475/03.2015.01
Jump to section
Related Articles
- No related articles found.
Cited By...
- Termite gas emissions select for hydrogenotrophic microbial communities in termite mounds
- Organic stabilization of extracellular elemental sulfur in a Sulfurovum-rich biofilm: a new role for EPS?
- Geochemical transition zone powering microbial growth in subsurface sediments
- Widespread energy limitation to life in global subseafloor sediments
- On the diversity of chemical power supply as a determinant of biological diversity
- Indigenous Ammonia-Oxidizing Archaea in Oxic Subseafloor Oceanic Crust
- Genomic expansion of archaeal lineages resolved from deep Costa Rica sediments
- In situ growth of anammox bacteria in subseafloor sediments
- Tracking electron uptake from a cathode into Shewanella cells: implications for generating maintenance energy from solid substrates
- Tracking Electron Uptake from a Cathode into Shewanella Cells: Implications for Energy Acquisition from Solid-Substrate Electron Donors
- The Physiology of Phagocytosis in the Context of Mitochondrial Origin